Davvero strano lo scarico laterale, può essere che abbiano avuto difficoltà nel recuperarne uno corretto?

Premetto che non sono esperto del modello ma a me sembra di ricordarlo frquente su R5 lo scarico disposto lateralmente.

Se non erro lo scarico laterale fu eliminato con la Phase 2. Non so se sia possibile montare quello laterale su una R5 nata con scarico classico...né dal punto di vista legale né dal punto di vista tecninco.

Lo scarico con uscita laterale era caratteristico delle versioni con motore 850cc (anche sulla R4), suppongo non sia un problema utilizzarlo sulle altre cilindrate

Esattamente, lo scarico laterale (che a me piace tantissimo) era previsto solo per le L 850cc della primissima serie.
Il ricambio oggi è il più comune tra gli scarichi per R5, non so perché, quindi la ragione è semplicemente questa.
E comunque monta perfettamente su qualunque versione per il semplice fatto che anche il tubo centrale delle maggiori o successive R5 passa dal sottoporta, quindi sono previsti attacchi in quel punto.